遼、西夏、金及蒙古諸族，都長于騎射，實行部族全民皆兵的征兵制度，建國后也征用漢族及其它民族為兵，實行征兵制為基礎的世兵制，父死子繼，世代為兵，稱為軍戶。
一、正骨金鏃科的獨立
宋代醫學中與軍事醫學有關者，為“瘡腫兼傷折”、“金瘡兼書禁”兩科。金代繼承了這一制度，至元代“正骨金鏃”成為獨立的學科，與“瘡腫”及“祝由書禁”分開，三科并立。這一方面，因為這一段時期戰爭頻繁激烈，宋、遼、西夏、金、元之間相互兼并，更有甚者，元朝曾以武力征服歐亞，戰爭中多傷亡，必將促進戰傷外科臨證醫學的發展。少數民族以騎兵為主，在戰爭時經常發生骨折損傷及箭傷，元代正骨金鏃科的獨立，很明顯地是為了服從戰爭的需要。
二、士兵的選擇
契丹、西夏、女真與蒙古，均以北方少數民族而統治中國。他們都是游牧民族，生長鞍馬，多為騎兵。人民每日逐獵，上馬則備戰斗，下馬則屯聚牧養，可以盡著軍籍。
金代對士兵的選擇已有規定。據《金史middot;兵志載：“凡選弩手之制，先以營造尺度杖，其長六尺，謂之等杖，取身與仗等，能踏弩至三石，鋪弦解索，登踏嫻習，射六箭皆上垛，內二箭中貼者”，“又選親軍，取身長五尺五寸，善騎射者。猛安、謀克以名上兵部（金代軍制，每25人為一謀克，四謀克為“千戶”猛安為千戶長），移點檢司、宣徽院試補之”；“又設護衛二百人，近侍之執兵仗者也，取五品至七品官子孫，及宗室并親軍諸局分承應之人，身長五尺六寸者，選補試之”。可見金代繼承了宋代的選試辦法，對士兵的身體素質和技藝已很重視。
三、傷病員的醫療
元代軍中有醫工從征，他們可以亨受免除徭役或賦稅的優待。如《元史middot;成宗本紀載：“元貞元年(1295)三月，詔免醫工門徭”，及“大德七年(1303)冬十月己丑，詔從軍醫工止復其妻子，戶如故”，金元著名的醫家如張從正及羅天益等都擔任過軍醫。在羅天益《衛生寶簽一書中，曾記載他在憲宗余年（1258）從征揚州時，治療被俘宋軍中流行的傳染時氣。
大德元年(1297)詔諸行省謹視各翼病軍。中書省議：諸翼屯戍軍人，果有殘病者，合于本名應請月糧內，減半支付新米粥養病。大德三年（1299)十二月，規定病軍除月糧外，另支新米一斗，煮熬粥飲，將養病軍。大德十一年(1307)十二月，詔和林、甘肅、云南、四川、兩廣、海北、海南、左右兩江鎮守新附軍人，除常例外，今歲量賜衣裝，遠方交換軍官、軍人、往還行糧依例應付。患病者官給醫藥，死者官為埋瘞，各處正官親臨提調，毋致夫所。延祐七年(1320)十月，和林、甘肅、云南、四川、福建、廣海鎮守新附漢軍，除常例外，每名除布一匹，病者官結醫藥，死者給燒埋(均見兵部卷之一典章34軍役)。
元代對戰傷的救護也有其獨特的經驗。如《元史載布智兒、郭寶玉、李庭等中箭及炮傷重，均剖牛腹置熱血中而蘇醒；張禧身中十八矢，得血竭飲之而生。《蒙古秘史)等文獻，還載有用燒紅的鐵烙止血術治流血傷口，用蒸汽熱罨的活血方法治療內傷，用牛羊瘤胃內反芻物作熱罨療法，及用熱血浸療治愈而傷等。
明代兵制與前代不同，一是參酌歷代兵制的利弊加以變通，建立了衛所制。根據地理位置、險要程度與設防需要，置衛或所。衛所均有固定防區，筑城置堡，大抵一府者設所，聯幾府者設衛。各省區設都指揮使以統轄衛所。又于險隘處設巡檢司，全士均編置于衛所中。二是組建獨立的火器部隊、火力與機動結合的戰車部隊及由步、騎、炮、車合成編組的新京營，使火器的殺傷作用在戰場上得到充分發揮。所以明代陸軍，除步、騎兩個傳統兵種外，出現了戰車和炮兵兩個新興兵種，水軍也較前代進步，在軍隊中占有重要地位。
(一)京軍及內地衛所的軍醫
《大明匯典middot;太醫院載，京軍中的醫官、醫士由太醫院派遣。
據洪武四年(1371)統計，三大營(五軍、神機和神樞營)，平均17300人中有醫官或醫士1人。
景泰間(1450～1456)于謙設十團營，平均萬人有醫生1名。
內地衛所也有軍醫編制、金幼孜《北征錄說，有毒藥將，由善修合藥餌的人充任；醫人將，由善醫治病的人充任；醫馬將，招善醫馬病的人充當。說明軍隊已有司藥、軍醫和獸醫編制。
戚繼光《紀效新書說，戚家軍中有醫士2名，醫獸1名。《練兵實紀載，在騎兵、步兵及車兵中均有醫士1名。
可見，明代軍醫編制人數不多，可能是太醫院只規定了醫官和醫士員額，不包括醫生在內。因當時醫生地位尚不及士兵，所以沒有記載。
(二)邊境衛所中的軍醫
明代由于常與蒙古、后金(清)等民族發生戰爭，沿邊關一帶設置了衛所14處，每處由太醫院派醫士1或2人擔任醫療。約1120～5600人中有醫士1名。如軍中缺醫，可由總兵或巡撫奏請，由太醫院拔用。
(三)海軍軍醫
明代沿海邊防也采用衛所制度。每衛官兵5600人，設指揮1人統領，衛下設千戶所5個，每千戶所下設百戶所10個，每百戶所有官兵112人，設百戶1員，衛所設有醫士1名，戰船上是否有醫生，未見記載。
鄭和、張謙等帶兵出使西洋時，隨船帶有醫官、醫士，平均150人中有醫士1名，即每船有醫士3名，民醫數字未則己載，若計入醫生人數應超過180人。