炮聲響過之后，城下的百姓頓時倒下了一片，而其他的百姓也知道,原來城上是來真的了，因此也紛紛向后退去，而在后面的清軍立刻揮動著長槍皮鞭，企圖將他們再驅趕回去，但城頭上的火炮也還在接連不斷的發射，百姓們根本不敢再回到陣地上，雙方也推搡起來。
這時在穆陵關的城頭上，穆陵軍的士兵們也對被俘虜的清兵展開了極端殘忍的報復手段，毎一個人都手執一把利刃,在清兵身上猛捅著,將自已心中的怒火全都發泄這這五十多名俘虜身上，而且都尊守著商毅的吩咐，不要一下子就把他們弄死了，那樣太便易他們，而是留著他們一口氣，讓他們多受一點活罪。
其實俘虜之中，差不多有一半都是漢族人，紛紛用漢語向穆陵軍求僥，但跟本就沒有人理睬他們。商毅對這些人更不同情，因為在后世的歷史證明，偽軍往往比鬼子更可恨。何況這群偽清兵那一個手里沒有幾條大明百姓的人命。現在也只能為他們當初的投敵行為付出代價。
而在城下的圖爾格和博洛，還有清軍的眾甲喇、牛錄們聽著城頭上的清兵發出的一聲聲撕心裂肺的慘叫，一個個也都氣得頓足捶胸，還有人落淚。這種事情，從努爾哈赤建立后金以來，還是從來沒有過的事情。
圖爾格厲聲道：“把明狗都趕回去，讓他們被自己人的大炮打死。把我們軍中剩下的明狗也都趕出去，讓他們全都死在自己人的手里，快，快。”
但就在這時，被清軍驅趕的百姓中，也不知是那一個人，忽然輪起自己手里的鋤頭，對著面前一個清軍的頭上狠狠的打去。那名淸兵萬萬也沒有想到，一向溫順軟弱，逆來順受的大明百姓居然也會反抗，一時沒有防備，被這一鋤頭正擊中在頭盔上。雖然他戴著是鐵盔，但也經不起這一下猛烈的撞擊，頓時兩眼一翻，昏死了過去。
而那名百姓見自己打倒了一名清兵，立刻一舉鋤頭，大聲道：“鄉親們，左右也是個死，不如和韃子們拼了，總比死在自己人的大炮手里強。”
他正說著，忽然又有一名清兵沖過來，一舉手中的長槍，對著這名百姓狠狠刺過來，那百姓躲閃不及，身上又沒有任何衣甲遮擋，頓時被這一槍刺透了前胸，槍尖從后背冒了出來。
清兵一槍得手，心里正在得意，忽然見那百姓對自己一笑，不禁心里也有些發毛。這時那百姓大叫了一聲：“鄉親們，拼了。”猛的向前一竄，身子在槍桿上又滑了兩尺多，來到了那淸兵的近前，一把死死抱住了那清兵，一口狠狠的咬在他的臉上。
清兵只疼得大聲慘叫，也放開了槍桿，抱住了那百姓，兩人一齊滾在地上，廝打起來。
而這時其他的百姓終于也爆發了起來，一面大吼著：“拼了，和韃孑拼了。”一面向清兵撲了過去。手里有家伙的舉起了家伙，沒頭沒腦向清兵猛打，沒有家伙的就用赤手空拳，和驅趕著他們的清兵拼命撕打在一起。拳打、腳踢、用牙咬，用頭撞，總之什么都用上了。在憤怒的百姓面前，驅趕他們的清兵也變得恐懼起來，被百姓打得連連后退，打死打傷了數十人。
圖爾格和博洛也看得目瞪口呆，他們也萬萬沒有想到，過去一直有效的驅趕百姓攻城，竟然會變成這樣一個結果，這還是他們眼里，一向溫順軟弱，逆來順受，受了欺負，也只能默默忍受，從來都不敢反抗的明朝百姓嗎？分明就是一群憤怒的雄獅。
盡管自己離暴動的百姓還有幾十步的距離，但圖爾格還是不由自主的后退了幾步，向左右看了看，忽然神經質一般的大叫了起來：“殺，殺，殺死他們，殺光他們。”
左右的清兵聽了，立刻也都一擁而上，殺向百姓們。
先前能夠占到上風，還是因為驅趕百姓的清軍人數不多，而百姓們也靠著一股血氣之勇，現在清軍的大隊人馬一上來，百姓們剛才那股血氣之勇也耗得差不多了，頓時都抵擋不住了，被清軍殺得紛紛倒地而亡。剩佘的百姓見了，也紛紛轉頭，向穆陵關的方向跑去。
而圖爾格也馬上下令，命兩個漢軍牛錄去追殺百姓，同時也下令，開始攻城。而這一次，索性連盾車也不用了，就這么舉著云梯，向城墻沖殺過去。
這時關上的守兵們早己停了炮擊，看見百姓們發動了反抗，也紛紛為百姓們喊采叫好，后來見百姓被清軍殺得向城墻的方向逃跑，商毅立刻命令炮手、弓箭手、火槍兵做好打擊清軍的準備。同時又命人打開城門，準備救援百姓。不過商毅可不敢再放下吊橋，而是命人用木板在防城壕溝上架出幾座獨木橋來，好讓跑得快的百姓過溝進城。反正現在是能救多少是多少。
清軍在后面追擊的剩余的百姓，雙方的首尾始終緊緊的咬在一起，難以分開。清軍追在百姓的后面，不斷的槍刺刀砍箭射，殺戮著百姓。而百姓也完全喪失了抵抗的意志，事實上也無法抵抗，只能拼命向關城的方向奔跑。
但這時的清軍同樣也被穆陵軍對俘虜的行為所激怒，盡管追擊百姓都是漢軍，但也知道，被激怒的滿八旗兵是多么可怕，他們跟本就不會和自己講什么道理，只要看你不順眼，就會一刀砍過來，因此在這個時候，可是不能有半點遲疑，盡管穆陵軍的炮火兇猛，但也不得不硬著頭皮向前沖，然后追殺著百姓。
很快清軍和百姓都越過了第一道壕溝，而這時城上的十五門火炮立刻再次開足了火力，將全軍的憤怒盡情的發泄到清兵的身上。
“轟轟轟轟！”巨大的轟鳴聲接連不斷的響聲，城外追擊百姓的清兵就像割麥子一樣，成排成片的倒下。當然因為這個時候清軍和百姓糾纏在一起，誤傷一部份百姓也是再所難免。但如果不這樣做，是沒有辦法將追擊的淸軍和百姓分隔開，因此商毅也只能犧牲一部份百姓，挽救另一部百姓了。
這一次清軍突進的速度很快，而且漢軍多半都沒有那么厚重的盔甲，因此在行動上比滿八旗兵有優勢，幾乎都是從百米沖刺的速度前進，沒過一會兒，就越過了三道壕溝和矮墻。但在穆陵軍的猛烈打擊下，終于切斷了清軍與百姓的連結，雙方拉開了一段距離。
而這時也以有不少幸存的百姓以經跑到了護城壕溝邊，因此商毅下令，所有的長弓、短弓、火銃都集向距離城墻三十多步的地方發射，將清軍擋住，為救援百姓進城，爭取時間。
因此這時在城頭上，火銃弓箭一齊開動，子彈、箭枝幾乎如同雨點一般密集，打得淸軍在距離城墻三十多步的地方，幾乎無法再進前一步。這個時候，漢軍盔甲單薄的劣勢也體現出來，在這個距離上，單層的鐵甲幾乎毫無防護力，只要是被中命，就不死即傷。大量漢軍都堆倒在這個距離的地方，尸體堆積，幾乎形成了一條涇渭分明的分界線。
而穆陵軍的士兵們一面拼命發射著弓箭火銃，一面大聲吼著：“打，打死這群狗曰的韃子，為鄉親們報仇。”
“來呀，都沖過來呀，看老子是怎么殺光你們的。”
不過就在穆陵軍和追擊百姓的清軍糾纏的時候，已有二個牛錄的清軍和三個牛錄的漢軍扛著云梯，十分順利的逼近到了城墻邊。這也里因為穆陵軍為了救援百姓，而不得不對第二批攻城的清軍放松打擊的結果。
在三四十步的距離內，也是清軍可以反擊的范圍，白甲兵、馬兵、戰兵、步兵也紛紛彎弓搭箭，射向城頭的穆陵軍。在十余名穆陵軍的火槍兵中箭之后，其他人紛紛將擋牌放在城垛口上，這樣一來，到是降低了許多火槍兵的傷害，但穆陵軍對城下的打擊力度也下降了不少，畢竟這樣一來，一個城垛口就只能有一個火槍兵來射擊，其他的弓箭手暫時都沒有了用武之地。
因此清軍也終于突破了這一條死亡地帶，向穆陵關的城墻邊靠隴過去。好在這時逃到城墻邊的百姓基本也都被順利的救進了關城里去，就在淸軍靠近護城壕溝的一刻，守兵們提早了一步，撤下了跳板，全部都退進了關城里去。
雖然放清軍靠近了城墻，但現在穆陵軍也可以心無傍鷲的全力對付攻城的清軍了。商毅也立刻下令，命火槍手都退到后面高臺上去，而弓箭手都退到城墻后面的箭塔上，繼續遠程打擊清軍，而把城垛口的位置留出來給長槍兵防守。同時又調了一部份長槍兵和刀盾兵在城墻上協防，準備與蹬上城頭的淸軍作短兵相接的白刃戰。
等這一切布置都準備就緒之后，清軍也在護城壕溝上搭好了跳板，扛著云梯越過了壕溝，架靠在城墻邊上，開始向城頭上攀爬。殘酷的攻城戰，開始了。